Kekerapan pembasmian kuman stetoskop bergantung pada senario penggunaan dan persekitaran:
Di jabatan pesakit luar biasa, jika stetoskop hanya digunakan untuk pesakit umum dan tiada pencemaran yang jelas, adalah disyorkan untuk membasmi kuman 1-2 kali seminggu.
Di jabatan seperti pediatrik dan bahagian pernafasan yang mudah terdedah kepada patogen berjangkit, atau di kawasan khas seperti wad penyakit berjangkit dan unit rawatan rapi, pembasmian kuman perlu dilakukan selepas setiap penggunaan.
Jika stetoskop digunakan oleh berbilang pesakit yang berbeza dalam tempoh masa yang singkat, adalah lebih baik untuk membasmi kuman selepas setiap penggunaan, walaupun selang masa pendek.